Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTRA1Q92743 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms