Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RABGGTAQ92696 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RABGGTAQ92696 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABGGTAQ92696 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
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