Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A6Q92581 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A6Q92581 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A6Q92581 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms