Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
UBXN4Q92575 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN4Q92575 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN4Q92575 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN4Q92575 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN4Q92575 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN4Q92575 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBXN4Q92575 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBXN4Q92575 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBXN4Q92575 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBXN4Q92575 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBXN4Q92575 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
UBXN4Q92575 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBXN4Q92575 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBXN4Q92575 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBXN4Q92575 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBXN4Q92575 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBXN4Q92575 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBXN4Q92575 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBXN4Q92575 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBXN4Q92575 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBXN4Q92575 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBXN4Q92575 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBXN4Q92575 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBXN4Q92575 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBXN4Q92575 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
UBXN4Q92575 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBXN4Q92575 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBXN4Q92575 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBXN4Q92575 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN4Q92575 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN4Q92575 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN4Q92575 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN4Q92575 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN4Q92575 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBXN4Q92575 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBXN4Q92575 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN4Q92575 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBXN4Q92575 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBXN4Q92575 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBXN4Q92575 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBXN4Q92575 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms