Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATRIPQ8WXE1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATRIPQ8WXE1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ATRIPQ8WXE1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATRIPQ8WXE1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATRIPQ8WXE1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATRIPQ8WXE1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATRIPQ8WXE1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATRIPQ8WXE1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATRIPQ8WXE1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATRIPQ8WXE1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATRIPQ8WXE1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATRIPQ8WXE1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATRIPQ8WXE1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATRIPQ8WXE1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATRIPQ8WXE1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATRIPQ8WXE1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATRIPQ8WXE1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATRIPQ8WXE1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATRIPQ8WXE1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATRIPQ8WXE1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATRIPQ8WXE1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms