Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJA4Q8WW22 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJA4Q8WW22 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJA4Q8WW22 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms