Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
TRIM41Q8WV44 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
TRIM41Q8WV44 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
TRIM41Q8WV44 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
TRIM41Q8WV44 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC43.05■■■■■ 4.48
TRIM41Q8WV44 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
TRIM41Q8WV44 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
TRIM41Q8WV44 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
TRIM41Q8WV44 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
TRIM41Q8WV44 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
TRIM41Q8WV44 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC43.04■■■■■ 4.48
TRIM41Q8WV44 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
TRIM41Q8WV44 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
TRIM41Q8WV44 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
TRIM41Q8WV44 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
TRIM41Q8WV44 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
TRIM41Q8WV44 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
TRIM41Q8WV44 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC43■■■■■ 4.47
TRIM41Q8WV44 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
TRIM41Q8WV44 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
TRIM41Q8WV44 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
TRIM41Q8WV44 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
TRIM41Q8WV44 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
TRIM41Q8WV44 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
TRIM41Q8WV44 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
TRIM41Q8WV44 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
TRIM41Q8WV44 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
TRIM41Q8WV44 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
TRIM41Q8WV44 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
TRIM41Q8WV44 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
TRIM41Q8WV44 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
TRIM41Q8WV44 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
TRIM41Q8WV44 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
TRIM41Q8WV44 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
TRIM41Q8WV44 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
TRIM41Q8WV44 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
TRIM41Q8WV44 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
TRIM41Q8WV44 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
TRIM41Q8WV44 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
TRIM41Q8WV44 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
TRIM41Q8WV44 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
TRIM41Q8WV44 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
TRIM41Q8WV44 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
TRIM41Q8WV44 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
TRIM41Q8WV44 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
TRIM41Q8WV44 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
TRIM41Q8WV44 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
TRIM41Q8WV44 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC42.91■■■■■ 4.46
TRIM41Q8WV44 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
TRIM41Q8WV44 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
TRIM41Q8WV44 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
TRIM41Q8WV44 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
TRIM41Q8WV44 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
TRIM41Q8WV44 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
TRIM41Q8WV44 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
TRIM41Q8WV44 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
TRIM41Q8WV44 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
TRIM41Q8WV44 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
TRIM41Q8WV44 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
TRIM41Q8WV44 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
TRIM41Q8WV44 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
TRIM41Q8WV44 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
TRIM41Q8WV44 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.85■■■■■ 4.45
TRIM41Q8WV44 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
TRIM41Q8WV44 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
TRIM41Q8WV44 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
TRIM41Q8WV44 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
TRIM41Q8WV44 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
TRIM41Q8WV44 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC42.83■■■■■ 4.45
TRIM41Q8WV44 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
TRIM41Q8WV44 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
TRIM41Q8WV44 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
TRIM41Q8WV44 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
TRIM41Q8WV44 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
TRIM41Q8WV44 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
TRIM41Q8WV44 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
TRIM41Q8WV44 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
TRIM41Q8WV44 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
TRIM41Q8WV44 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
TRIM41Q8WV44 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
TRIM41Q8WV44 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
TRIM41Q8WV44 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
TRIM41Q8WV44 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
TRIM41Q8WV44 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
TRIM41Q8WV44 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
TRIM41Q8WV44 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
TRIM41Q8WV44 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
TRIM41Q8WV44 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
TRIM41Q8WV44 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC42.77■■■■■ 4.44
TRIM41Q8WV44 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC42.77■■■■■ 4.44
TRIM41Q8WV44 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
TRIM41Q8WV44 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
TRIM41Q8WV44 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
TRIM41Q8WV44 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
TRIM41Q8WV44 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
TRIM41Q8WV44 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
TRIM41Q8WV44 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
TRIM41Q8WV44 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC42.75■■■■■ 4.43
TRIM41Q8WV44 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
TRIM41Q8WV44 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms