Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMCE1Q8WV22 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMCE1Q8WV22 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMCE1Q8WV22 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMCE1Q8WV22 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMCE1Q8WV22 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSMCE1Q8WV22 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NSMCE1Q8WV22 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NSMCE1Q8WV22 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NSMCE1Q8WV22 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NSMCE1Q8WV22 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NSMCE1Q8WV22 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NSMCE1Q8WV22 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSMCE1Q8WV22 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSMCE1Q8WV22 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSMCE1Q8WV22 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSMCE1Q8WV22 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NSMCE1Q8WV22 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSMCE1Q8WV22 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSMCE1Q8WV22 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSMCE1Q8WV22 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSMCE1Q8WV22 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSMCE1Q8WV22 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSMCE1Q8WV22 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSMCE1Q8WV22 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSMCE1Q8WV22 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSMCE1Q8WV22 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSMCE1Q8WV22 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSMCE1Q8WV22 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSMCE1Q8WV22 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSMCE1Q8WV22 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSMCE1Q8WV22 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSMCE1Q8WV22 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSMCE1Q8WV22 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSMCE1Q8WV22 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSMCE1Q8WV22 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSMCE1Q8WV22 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSMCE1Q8WV22 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSMCE1Q8WV22 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSMCE1Q8WV22 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSMCE1Q8WV22 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSMCE1Q8WV22 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSMCE1Q8WV22 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSMCE1Q8WV22 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSMCE1Q8WV22 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMCE1Q8WV22 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMCE1Q8WV22 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMCE1Q8WV22 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSMCE1Q8WV22 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSMCE1Q8WV22 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSMCE1Q8WV22 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSMCE1Q8WV22 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms