Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH3RF2Q8TEC5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH3RF2Q8TEC5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH3RF2Q8TEC5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH3RF2Q8TEC5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SH3RF2Q8TEC5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3RF2Q8TEC5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3RF2Q8TEC5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3RF2Q8TEC5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3RF2Q8TEC5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3RF2Q8TEC5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3RF2Q8TEC5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3RF2Q8TEC5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3RF2Q8TEC5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3RF2Q8TEC5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3RF2Q8TEC5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3RF2Q8TEC5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3RF2Q8TEC5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH3RF2Q8TEC5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH3RF2Q8TEC5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH3RF2Q8TEC5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH3RF2Q8TEC5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH3RF2Q8TEC5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH3RF2Q8TEC5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SH3RF2Q8TEC5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SH3RF2Q8TEC5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SH3RF2Q8TEC5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH3RF2Q8TEC5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3RF2Q8TEC5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3RF2Q8TEC5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3RF2Q8TEC5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3RF2Q8TEC5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3RF2Q8TEC5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3RF2Q8TEC5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3RF2Q8TEC5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3RF2Q8TEC5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3RF2Q8TEC5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3RF2Q8TEC5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3RF2Q8TEC5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3RF2Q8TEC5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3RF2Q8TEC5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3RF2Q8TEC5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3RF2Q8TEC5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3RF2Q8TEC5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3RF2Q8TEC5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3RF2Q8TEC5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3RF2Q8TEC5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3RF2Q8TEC5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3RF2Q8TEC5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3RF2Q8TEC5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3RF2Q8TEC5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3RF2Q8TEC5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3RF2Q8TEC5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3RF2Q8TEC5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3RF2Q8TEC5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3RF2Q8TEC5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3RF2Q8TEC5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3RF2Q8TEC5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3RF2Q8TEC5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3RF2Q8TEC5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms