Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR2

STK35, Serine/threonine-protein kinase 35, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STK35Q8TDR2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STK35Q8TDR2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
STK35Q8TDR2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STK35Q8TDR2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms