Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMO3Q8TAP4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO3Q8TAP4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO3Q8TAP4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO3Q8TAP4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO3Q8TAP4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO3Q8TAP4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMO3Q8TAP4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMO3Q8TAP4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMO3Q8TAP4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMO3Q8TAP4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMO3Q8TAP4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMO3Q8TAP4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMO3Q8TAP4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMO3Q8TAP4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMO3Q8TAP4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMO3Q8TAP4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMO3Q8TAP4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMO3Q8TAP4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO3Q8TAP4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO3Q8TAP4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO3Q8TAP4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO3Q8TAP4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO3Q8TAP4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO3Q8TAP4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms