Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATL2Q8NHH9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATL2Q8NHH9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ATL2Q8NHH9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATL2Q8NHH9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATL2Q8NHH9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATL2Q8NHH9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATL2Q8NHH9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATL2Q8NHH9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATL2Q8NHH9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATL2Q8NHH9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATL2Q8NHH9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATL2Q8NHH9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATL2Q8NHH9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATL2Q8NHH9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATL2Q8NHH9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATL2Q8NHH9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATL2Q8NHH9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATL2Q8NHH9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATL2Q8NHH9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATL2Q8NHH9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATL2Q8NHH9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ATL2Q8NHH9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATL2Q8NHH9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATL2Q8NHH9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATL2Q8NHH9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATL2Q8NHH9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms