Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APPL2Q8NEU8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APPL2Q8NEU8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APPL2Q8NEU8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APPL2Q8NEU8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APPL2Q8NEU8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
APPL2Q8NEU8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APPL2Q8NEU8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APPL2Q8NEU8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APPL2Q8NEU8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APPL2Q8NEU8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APPL2Q8NEU8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APPL2Q8NEU8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APPL2Q8NEU8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APPL2Q8NEU8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APPL2Q8NEU8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APPL2Q8NEU8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
APPL2Q8NEU8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APPL2Q8NEU8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APPL2Q8NEU8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APPL2Q8NEU8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APPL2Q8NEU8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APPL2Q8NEU8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APPL2Q8NEU8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APPL2Q8NEU8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APPL2Q8NEU8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APPL2Q8NEU8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APPL2Q8NEU8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APPL2Q8NEU8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APPL2Q8NEU8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
APPL2Q8NEU8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APPL2Q8NEU8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APPL2Q8NEU8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APPL2Q8NEU8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APPL2Q8NEU8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APPL2Q8NEU8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APPL2Q8NEU8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
APPL2Q8NEU8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
APPL2Q8NEU8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APPL2Q8NEU8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APPL2Q8NEU8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APPL2Q8NEU8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APPL2Q8NEU8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APPL2Q8NEU8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APPL2Q8NEU8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms