Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF548Q8NEK5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF548Q8NEK5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF548Q8NEK5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF548Q8NEK5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF548Q8NEK5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF548Q8NEK5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF548Q8NEK5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF548Q8NEK5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF548Q8NEK5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF548Q8NEK5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF548Q8NEK5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF548Q8NEK5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF548Q8NEK5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF548Q8NEK5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF548Q8NEK5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF548Q8NEK5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF548Q8NEK5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF548Q8NEK5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF548Q8NEK5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF548Q8NEK5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF548Q8NEK5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
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