Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG0

FAM71C, Protein FAM71C, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71CQ8NEG0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71CQ8NEG0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71CQ8NEG0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71CQ8NEG0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71CQ8NEG0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71CQ8NEG0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71CQ8NEG0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71CQ8NEG0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71CQ8NEG0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71CQ8NEG0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71CQ8NEG0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71CQ8NEG0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71CQ8NEG0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71CQ8NEG0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71CQ8NEG0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM71CQ8NEG0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM71CQ8NEG0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM71CQ8NEG0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM71CQ8NEG0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM71CQ8NEG0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM71CQ8NEG0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM71CQ8NEG0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM71CQ8NEG0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM71CQ8NEG0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71CQ8NEG0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71CQ8NEG0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71CQ8NEG0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71CQ8NEG0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71CQ8NEG0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71CQ8NEG0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71CQ8NEG0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms