Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHE23Q8NDY6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BHLHE23Q8NDY6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms