Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A9Q8NBW4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC38A9Q8NBW4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC38A9Q8NBW4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC38A9Q8NBW4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A9Q8NBW4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A9Q8NBW4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A9Q8NBW4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A9Q8NBW4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A9Q8NBW4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A9Q8NBW4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A9Q8NBW4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A9Q8NBW4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A9Q8NBW4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A9Q8NBW4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A9Q8NBW4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A9Q8NBW4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A9Q8NBW4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A9Q8NBW4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A9Q8NBW4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A9Q8NBW4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A9Q8NBW4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC38A9Q8NBW4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC38A9Q8NBW4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC38A9Q8NBW4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A9Q8NBW4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms