Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COLGALT1Q8NBJ5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COLGALT1Q8NBJ5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COLGALT1Q8NBJ5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COLGALT1Q8NBJ5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COLGALT1Q8NBJ5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COLGALT1Q8NBJ5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COLGALT1Q8NBJ5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
COLGALT1Q8NBJ5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COLGALT1Q8NBJ5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COLGALT1Q8NBJ5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COLGALT1Q8NBJ5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COLGALT1Q8NBJ5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COLGALT1Q8NBJ5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COLGALT1Q8NBJ5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COLGALT1Q8NBJ5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
COLGALT1Q8NBJ5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COLGALT1Q8NBJ5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COLGALT1Q8NBJ5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COLGALT1Q8NBJ5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COLGALT1Q8NBJ5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COLGALT1Q8NBJ5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COLGALT1Q8NBJ5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
COLGALT1Q8NBJ5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COLGALT1Q8NBJ5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
COLGALT1Q8NBJ5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COLGALT1Q8NBJ5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms