Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMNTD1Q8N9Z9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNTD1Q8N9Z9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms