Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FAM71DQ8N9W8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FAM71DQ8N9W8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM71DQ8N9W8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM71DQ8N9W8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM71DQ8N9W8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM71DQ8N9W8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM71DQ8N9W8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM71DQ8N9W8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM71DQ8N9W8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM71DQ8N9W8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM71DQ8N9W8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM71DQ8N9W8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM71DQ8N9W8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM71DQ8N9W8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM71DQ8N9W8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM71DQ8N9W8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM71DQ8N9W8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM71DQ8N9W8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM71DQ8N9W8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM71DQ8N9W8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM71DQ8N9W8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM71DQ8N9W8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM71DQ8N9W8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM71DQ8N9W8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM71DQ8N9W8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM71DQ8N9W8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM71DQ8N9W8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM71DQ8N9W8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM71DQ8N9W8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM71DQ8N9W8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM71DQ8N9W8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM71DQ8N9W8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM71DQ8N9W8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM71DQ8N9W8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM71DQ8N9W8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM71DQ8N9W8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM71DQ8N9W8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM71DQ8N9W8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM71DQ8N9W8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM71DQ8N9W8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
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