Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC17Q8N6Y2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC17Q8N6Y2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms