Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf62Q8N4C0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
C9orf62Q8N4C0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf62Q8N4C0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf62Q8N4C0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf62Q8N4C0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf62Q8N4C0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf62Q8N4C0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf62Q8N4C0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf62Q8N4C0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.3 ms