Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SFRP1Q8N474 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFRP1Q8N474 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms