Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC43Q8N309 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC43Q8N309 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC43Q8N309 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC43Q8N309 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC43Q8N309 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC43Q8N309 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC43Q8N309 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC43Q8N309 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC43Q8N309 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LRRC43Q8N309 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LRRC43Q8N309 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
LRRC43Q8N309 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC43Q8N309 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC43Q8N309 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms