Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2H9

PELI3, E3 ubiquitin-protein ligase pellino homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PELI3Q8N2H9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PELI3Q8N2H9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PELI3Q8N2H9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PELI3Q8N2H9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PELI3Q8N2H9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PELI3Q8N2H9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PELI3Q8N2H9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PELI3Q8N2H9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PELI3Q8N2H9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PELI3Q8N2H9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PELI3Q8N2H9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PELI3Q8N2H9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PELI3Q8N2H9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PELI3Q8N2H9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PELI3Q8N2H9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PELI3Q8N2H9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PELI3Q8N2H9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PELI3Q8N2H9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PELI3Q8N2H9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms