Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CMTR1Q8N1G2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CMTR1Q8N1G2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CMTR1Q8N1G2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CMTR1Q8N1G2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CMTR1Q8N1G2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CMTR1Q8N1G2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CMTR1Q8N1G2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CMTR1Q8N1G2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CMTR1Q8N1G2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CMTR1Q8N1G2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CMTR1Q8N1G2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CMTR1Q8N1G2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CMTR1Q8N1G2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CMTR1Q8N1G2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CMTR1Q8N1G2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CMTR1Q8N1G2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CMTR1Q8N1G2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CMTR1Q8N1G2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CMTR1Q8N1G2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CMTR1Q8N1G2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CMTR1Q8N1G2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CMTR1Q8N1G2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CMTR1Q8N1G2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms