Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYJ3

SYTL1, Synaptotagmin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1Q8IYJ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYTL1Q8IYJ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYTL1Q8IYJ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYTL1Q8IYJ3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYTL1Q8IYJ3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYTL1Q8IYJ3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYTL1Q8IYJ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYTL1Q8IYJ3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYTL1Q8IYJ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYTL1Q8IYJ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYTL1Q8IYJ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYTL1Q8IYJ3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYTL1Q8IYJ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYTL1Q8IYJ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYTL1Q8IYJ3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYTL1Q8IYJ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYTL1Q8IYJ3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms