Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
VSTM4Q8IW00 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VSTM4Q8IW00 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VSTM4Q8IW00 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VSTM4Q8IW00 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VSTM4Q8IW00 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VSTM4Q8IW00 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VSTM4Q8IW00 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VSTM4Q8IW00 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VSTM4Q8IW00 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VSTM4Q8IW00 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSTM4Q8IW00 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSTM4Q8IW00 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSTM4Q8IW00 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSTM4Q8IW00 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSTM4Q8IW00 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSTM4Q8IW00 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSTM4Q8IW00 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSTM4Q8IW00 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSTM4Q8IW00 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VSTM4Q8IW00 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VSTM4Q8IW00 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VSTM4Q8IW00 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VSTM4Q8IW00 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VSTM4Q8IW00 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VSTM4Q8IW00 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VSTM4Q8IW00 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VSTM4Q8IW00 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VSTM4Q8IW00 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VSTM4Q8IW00 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VSTM4Q8IW00 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VSTM4Q8IW00 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VSTM4Q8IW00 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VSTM4Q8IW00 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VSTM4Q8IW00 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VSTM4Q8IW00 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VSTM4Q8IW00 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VSTM4Q8IW00 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VSTM4Q8IW00 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VSTM4Q8IW00 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VSTM4Q8IW00 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VSTM4Q8IW00 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VSTM4Q8IW00 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VSTM4Q8IW00 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VSTM4Q8IW00 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms