Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT12Q8IV01 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT12Q8IV01 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms