Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD3

TMEM25, Transmembrane protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM25Q86YD3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMEM25Q86YD3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM25Q86YD3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM25Q86YD3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM25Q86YD3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM25Q86YD3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM25Q86YD3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM25Q86YD3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM25Q86YD3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM25Q86YD3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM25Q86YD3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM25Q86YD3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM25Q86YD3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM25Q86YD3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM25Q86YD3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM25Q86YD3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM25Q86YD3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM25Q86YD3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM25Q86YD3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM25Q86YD3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms