Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PACS2Q86VP3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PACS2Q86VP3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms