Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM15Q7Z3B0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMIM15Q7Z3B0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMIM15Q7Z3B0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMIM15Q7Z3B0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM15Q7Z3B0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM15Q7Z3B0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms