Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT3

SSX9, Protein SSX9, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX9Q7RTT3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX9Q7RTT3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms