Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MED13LQ71F56 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED13LQ71F56 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED13LQ71F56 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MED13LQ71F56 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED13LQ71F56 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED13LQ71F56 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED13LQ71F56 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED13LQ71F56 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED13LQ71F56 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED13LQ71F56 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED13LQ71F56 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED13LQ71F56 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED13LQ71F56 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED13LQ71F56 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED13LQ71F56 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED13LQ71F56 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED13LQ71F56 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED13LQ71F56 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED13LQ71F56 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MED13LQ71F56 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED13LQ71F56 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED13LQ71F56 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED13LQ71F56 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED13LQ71F56 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED13LQ71F56 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms