Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEND4Q6ZU67 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEND4Q6ZU67 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BEND4Q6ZU67 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEND4Q6ZU67 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BEND4Q6ZU67 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BEND4Q6ZU67 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEND4Q6ZU67 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BEND4Q6ZU67 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEND4Q6ZU67 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEND4Q6ZU67 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEND4Q6ZU67 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEND4Q6ZU67 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEND4Q6ZU67 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEND4Q6ZU67 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEND4Q6ZU67 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEND4Q6ZU67 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEND4Q6ZU67 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEND4Q6ZU67 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEND4Q6ZU67 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEND4Q6ZU67 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEND4Q6ZU67 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEND4Q6ZU67 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEND4Q6ZU67 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEND4Q6ZU67 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BEND4Q6ZU67 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms