Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM43BQ6ZT52 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM43BQ6ZT52 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM43BQ6ZT52 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM43BQ6ZT52 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM43BQ6ZT52 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM43BQ6ZT52 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM43BQ6ZT52 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM43BQ6ZT52 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM43BQ6ZT52 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM43BQ6ZT52 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM43BQ6ZT52 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM43BQ6ZT52 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM43BQ6ZT52 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM43BQ6ZT52 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM43BQ6ZT52 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM43BQ6ZT52 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM43BQ6ZT52 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM43BQ6ZT52 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms