Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GBP6Q6ZN66 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GBP6Q6ZN66 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GBP6Q6ZN66 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GBP6Q6ZN66 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GBP6Q6ZN66 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GBP6Q6ZN66 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GBP6Q6ZN66 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GBP6Q6ZN66 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GBP6Q6ZN66 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GBP6Q6ZN66 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GBP6Q6ZN66 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GBP6Q6ZN66 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GBP6Q6ZN66 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GBP6Q6ZN66 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GBP6Q6ZN66 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GBP6Q6ZN66 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GBP6Q6ZN66 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GBP6Q6ZN66 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GBP6Q6ZN66 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GBP6Q6ZN66 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GBP6Q6ZN66 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GBP6Q6ZN66 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GBP6Q6ZN66 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GBP6Q6ZN66 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GBP6Q6ZN66 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GBP6Q6ZN66 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GBP6Q6ZN66 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GBP6Q6ZN66 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GBP6Q6ZN66 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GBP6Q6ZN66 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GBP6Q6ZN66 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GBP6Q6ZN66 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GBP6Q6ZN66 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GBP6Q6ZN66 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GBP6Q6ZN66 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GBP6Q6ZN66 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GBP6Q6ZN66 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GBP6Q6ZN66 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GBP6Q6ZN66 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GBP6Q6ZN66 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GBP6Q6ZN66 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GBP6Q6ZN66 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP6Q6ZN66 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GBP6Q6ZN66 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GBP6Q6ZN66 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GBP6Q6ZN66 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms