Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZRN4Q6ZMN7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDZRN4Q6ZMN7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDZRN4Q6ZMN7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDZRN4Q6ZMN7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PDZRN4Q6ZMN7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PDZRN4Q6ZMN7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZRN4Q6ZMN7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZRN4Q6ZMN7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZRN4Q6ZMN7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDZRN4Q6ZMN7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDZRN4Q6ZMN7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDZRN4Q6ZMN7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDZRN4Q6ZMN7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDZRN4Q6ZMN7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDZRN4Q6ZMN7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDZRN4Q6ZMN7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDZRN4Q6ZMN7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDZRN4Q6ZMN7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDZRN4Q6ZMN7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDZRN4Q6ZMN7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms