Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMD2

SPNS3, Protein spinster homolog 3, humanhuman

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Length 512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3Q6ZMD2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPNS3Q6ZMD2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
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