Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CYP26C1Q6V0L0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CYP26C1Q6V0L0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYP26C1Q6V0L0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CYP26C1Q6V0L0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYP26C1Q6V0L0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CYP26C1Q6V0L0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYP26C1Q6V0L0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CYP26C1Q6V0L0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CYP26C1Q6V0L0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CYP26C1Q6V0L0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CYP26C1Q6V0L0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CYP26C1Q6V0L0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CYP26C1Q6V0L0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CYP26C1Q6V0L0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CYP26C1Q6V0L0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CYP26C1Q6V0L0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CYP26C1Q6V0L0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CYP26C1Q6V0L0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CYP26C1Q6V0L0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CYP26C1Q6V0L0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP26C1Q6V0L0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP26C1Q6V0L0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP26C1Q6V0L0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP26C1Q6V0L0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP26C1Q6V0L0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP26C1Q6V0L0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP26C1Q6V0L0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP26C1Q6V0L0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP26C1Q6V0L0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP26C1Q6V0L0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP26C1Q6V0L0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP26C1Q6V0L0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP26C1Q6V0L0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP26C1Q6V0L0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP26C1Q6V0L0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP26C1Q6V0L0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP26C1Q6V0L0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP26C1Q6V0L0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP26C1Q6V0L0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP26C1Q6V0L0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYP26C1Q6V0L0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CYP26C1Q6V0L0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms