Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI9

NPNT, Nephronectin, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPNTQ6UXI9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NPNTQ6UXI9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NPNTQ6UXI9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NPNTQ6UXI9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NPNTQ6UXI9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NPNTQ6UXI9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NPNTQ6UXI9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NPNTQ6UXI9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPNTQ6UXI9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPNTQ6UXI9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPNTQ6UXI9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPNTQ6UXI9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPNTQ6UXI9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPNTQ6UXI9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPNTQ6UXI9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPNTQ6UXI9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPNTQ6UXI9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPNTQ6UXI9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPNTQ6UXI9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPNTQ6UXI9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPNTQ6UXI9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPNTQ6UXI9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPNTQ6UXI9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPNTQ6UXI9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPNTQ6UXI9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NPNTQ6UXI9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NPNTQ6UXI9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPNTQ6UXI9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPNTQ6UXI9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPNTQ6UXI9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms