Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRCT1Q6UXD1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms