Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWH4

FAM198B, Protein FAM198B, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM198BQ6UWH4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM198BQ6UWH4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM198BQ6UWH4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM198BQ6UWH4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM198BQ6UWH4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM198BQ6UWH4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM198BQ6UWH4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM198BQ6UWH4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM198BQ6UWH4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM198BQ6UWH4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM198BQ6UWH4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM198BQ6UWH4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM198BQ6UWH4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM198BQ6UWH4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM198BQ6UWH4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM198BQ6UWH4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM198BQ6UWH4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM198BQ6UWH4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM198BQ6UWH4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM198BQ6UWH4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM198BQ6UWH4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM198BQ6UWH4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM198BQ6UWH4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms