Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB35

MTHFD1L, Monofunctional C1-tetrahydrofolate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1LQ6UB35 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MTHFD1LQ6UB35 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTHFD1LQ6UB35 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTHFD1LQ6UB35 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTHFD1LQ6UB35 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTHFD1LQ6UB35 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTHFD1LQ6UB35 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MTHFD1LQ6UB35 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTHFD1LQ6UB35 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTHFD1LQ6UB35 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTHFD1LQ6UB35 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTHFD1LQ6UB35 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTHFD1LQ6UB35 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MTHFD1LQ6UB35 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTHFD1LQ6UB35 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTHFD1LQ6UB35 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MTHFD1LQ6UB35 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTHFD1LQ6UB35 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTHFD1LQ6UB35 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTHFD1LQ6UB35 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTHFD1LQ6UB35 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTHFD1LQ6UB35 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MTHFD1LQ6UB35 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MTHFD1LQ6UB35 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTHFD1LQ6UB35 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MTHFD1LQ6UB35 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTHFD1LQ6UB35 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTHFD1LQ6UB35 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTHFD1LQ6UB35 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTHFD1LQ6UB35 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms