Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A47Q6Q0C1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A47Q6Q0C1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A47Q6Q0C1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A47Q6Q0C1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A47Q6Q0C1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A47Q6Q0C1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A47Q6Q0C1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A47Q6Q0C1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A47Q6Q0C1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A47Q6Q0C1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A47Q6Q0C1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A47Q6Q0C1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A47Q6Q0C1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A47Q6Q0C1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A47Q6Q0C1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A47Q6Q0C1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A47Q6Q0C1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A47Q6Q0C1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A47Q6Q0C1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A47Q6Q0C1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A47Q6Q0C1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC25A47Q6Q0C1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC25A47Q6Q0C1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.9 ms