Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAF7Q6Q0C0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF7Q6Q0C0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF7Q6Q0C0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF7Q6Q0C0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF7Q6Q0C0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF7Q6Q0C0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF7Q6Q0C0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF7Q6Q0C0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF7Q6Q0C0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAF7Q6Q0C0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAF7Q6Q0C0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAF7Q6Q0C0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF7Q6Q0C0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF7Q6Q0C0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF7Q6Q0C0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF7Q6Q0C0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF7Q6Q0C0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAF7Q6Q0C0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAF7Q6Q0C0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAF7Q6Q0C0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 927.5 ms