Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG9

LRFN4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN4Q6PJG9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN4Q6PJG9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms