Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHR2

ULK3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK3Q6PHR2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ULK3Q6PHR2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ULK3Q6PHR2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms