Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF05

TTC23L, Tetratricopeptide repeat protein 23-like, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC23LQ6PF05 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC23LQ6PF05 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC23LQ6PF05 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC23LQ6PF05 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC23LQ6PF05 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC23LQ6PF05 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC23LQ6PF05 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC23LQ6PF05 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC23LQ6PF05 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC23LQ6PF05 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC23LQ6PF05 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC23LQ6PF05 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTC23LQ6PF05 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC23LQ6PF05 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC23LQ6PF05 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms