Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHLDB3Q6NSJ2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PHLDB3Q6NSJ2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms